Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HmgcrQ01237 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HmgcrQ01237 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HmgcrQ01237 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms