Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col1a2Q01149 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a2Q01149 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms