Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Grin2bQ01097 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Grin2bQ01097 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2bQ01097 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms