Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde1bQ01065 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pde1bQ01065 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms