Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb2Q00977 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms