Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms