Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd80Q00609 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd80Q00609 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms