Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il6stQ00560 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Il6stQ00560 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il6stQ00560 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms