Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8a1Q00558 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms