Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PgrQ00175 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PgrQ00175 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms