Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp6P97868 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rbbp6P97868 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp6P97868 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms