Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gfra1P97785 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms