Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2cP97760 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2cP97760 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2cP97760 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2cP97760 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2cP97760 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr2cP97760 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2cP97760 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2cP97760 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2cP97760 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2cP97760 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr2cP97760 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms