Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd1P97443 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd1P97443 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms