Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkp1P97350 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkp1P97350 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms