Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccl21bP86792 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl21bP86792 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms