Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cct7P80313 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cct7P80313 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cct7P80313 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms