Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx2P80206 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms