Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx1P80205 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx1P80205 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Otx1P80205 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms