Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gfi1P70338 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms