Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbx6P70327 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tbx6P70327 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms