Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgif1P70284 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms