Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stra8P70278 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stra8P70278 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stra8P70278 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stra8P70278 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stra8P70278 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stra8P70278 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stra8P70278 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms