Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrig1P70193 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lrig1P70193 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms