Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Crip1P63254 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crip1P63254 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Crip1P63254 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms