Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrx1P63013 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prrx1P63013 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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