Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl8P62918 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms