Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl30P62889 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl30P62889 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rpl30P62889 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms