Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6P62754 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6P62754 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6P62754 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6P62754 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6P62754 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6P62754 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6P62754 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms