Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm3P62311 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lsm3P62311 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms