Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms