Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnnP61807 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SnnP61807 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnnP61807 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnnP61807 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnnP61807 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnnP61807 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnnP61807 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnnP61807 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnnP61807 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnnP61807 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnnP61807 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SnnP61807 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnnP61807 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnnP61807 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SnnP61807 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnnP61807 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SnnP61807 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms