Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme3P61290 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme3P61290 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms