Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sem1P60897 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms