Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ActbP60710 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ActbP60710 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ActbP60710 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ActbP60710 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ActbP60710 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ActbP60710 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms