Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppfia3P60469 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfia3P60469 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfia3P60469 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms