Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps33bP59016 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps33bP59016 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms