Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdl3P58873 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rhbdl3P58873 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdl3P58873 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms