Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tm6sf1P58749 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms