Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Strn4P58404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Strn4P58404 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Strn4P58404 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms