Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NcstnP57716 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NcstnP57716 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms