Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gsc2P56916 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gsc2P56916 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gsc2P56916 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gsc2P56916 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gsc2P56916 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsc2P56916 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gsc2P56916 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gsc2P56916 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gsc2P56916 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gsc2P56916 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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