Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdcd5P56812 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms