Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c40P56657 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cyp2c40P56657 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp2c40P56657 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms