Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GferP56213 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GferP56213 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GferP56213 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GferP56213 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GferP56213 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GferP56213 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GferP56213 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GferP56213 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GferP56213 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GferP56213 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms