Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rrp1P56183 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms