Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ephb3P54754 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ephb3P54754 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms