Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PitpnbP53811 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PitpnbP53811 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms