Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2e3P52483 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms