Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CcnfP51944 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CcnfP51944 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnfP51944 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcnfP51944 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms